清晨時刻，萬物蘇醒，身體的循環系統、內分泌系統等開始啟動，同時被喚醒的還有諸如高血壓、抑郁癥等疾病。要確保這些疾病的治療效果，以下藥物需要在清晨服用。
抗高血壓藥。一般人的血壓是夜間下降，早上醒來時開始上升。一天中，人的血壓在早晨和下午會各出現一次高峰。有不少人患“清晨高血壓癥”，這些患者更應在早上吃藥。為有效控壓，尤其是有清晨高血壓癥的患者，應選用藥力持續時間更長的降壓藥，如：氨氯地平、依那普利、貝那普利、拉西普利、培哚普利、福辛普利、雷米普利、厄貝沙坦、纈沙坦、氯沙坦、利血平等，一般應在早上7點左右服藥。有些藥效較短的降壓藥，每天下午4時半左右再補服1次。
腎上腺皮質激素，如潑尼松、地塞米松、潑尼松龍、倍他米松等。因為人體內激素的分泌高峰出現在早晨7～8點，此時服用藥物可避免藥物對激素分泌的反射性抑制作用，對下丘腦-垂體-腎上腺皮質的抑制較輕，可減少不良反應。
抗抑郁藥。抑郁的癥狀如憂郁、焦慮、猜疑等，常表現為清晨重、晚上輕，帕羅西汀、氟西汀、瑞波西汀、氟伏沙明等宜在清晨服用。
利尿藥。為避免夜間多次起夜，影響睡眠休息，呋塞米、螺內酯等利尿藥宜在清晨服用。
驅蟲藥。南瓜子、檳榔、甲硝唑、四氯乙烯宜在清晨空腹服，可迅速進入腸道，并保持高濃度。阿苯達唑、甲苯咪唑、哌嗪、雙羥萘酸嘧啶在清晨服，可減少人體對藥的吸收，增加藥與蟲體的接觸，增強療效。